Migraine après un Covid : pourquoi elle apparaît et que faire

Introduction Vous avez eu un Covid et, depuis, des maux de tête se sont installés. Parfois ce sont des migraines avec crises, parfois une douleur sourde qui ne vous quitte plus. Ce n'est pas dans votre tête. Ce n'est pas le stress non plus. La science a maintenant des éléments concrets pour expliquer ce qui se passe, et des pistes pour avancer.

Une nouvelle douleur, vraiment ?

Oui, et ce n'est pas marginal. Plusieurs études ont décrit l'apparition d'une nouvelle céphalée chez une partie des personnes qui ont eu un Covid. Cette douleur peut s'installer pendant la phase aiguë de l'infection, ou apparaître quelques semaines après. Et elle reste, parfois plusieurs mois.

Deux formes reviennent le plus souvent dans les consultations spécialisées^{[1] PMID 37078648[3] PMID 36197571}.

• Une migraine classique, parfois pour la première fois de la vie. La douleur arrive par crises, souvent d'un seul côté, avec des nausées, une gêne à la lumière et au bruit.
• Une céphalée quotidienne nouvelle, qu'on appelle NDPH. Elle apparaît brutalement, devient présente tous les jours dès le départ, sans pause. La date d'apparition peut souvent être donnée précisément.

Les deux formes peuvent coexister chez la même personne. Et toutes deux résistent souvent aux solutions habituelles que l'on connaissait avant le Covid.

Pourquoi la biologie le confirme

En 2024, une équipe allemande a publié un travail qui change la conversation. La cohorte PoCoRe comprenait 184 personnes vues en consultation post-Covid ; pour l'analyse détaillée des céphalées et des biomarqueurs, 93 participants ont été répartis en quatre groupes : aucune céphalée, céphalée inchangée, céphalée aggravée ou céphalée nouvelle^{[5] PMID 38890625}.

Le résultat est sans appel. Plusieurs marqueurs sont nettement plus élevés dans le sang des personnes qui souffrent.

• La Fractalkine (CX3CL1), une chimiokine impliquée notamment dans la communication avec les cellules CX3CR1+, dont la microglie. Son augmentation sanguine est compatible avec un état neuro-immunitaire différent, sans permettre à elle seule de mesurer directement l'activation microgliale dans le cerveau.
• Le β-NGF, un facteur qui rend les nerfs de la douleur plus sensibles. Des stimulations qui ne devraient pas faire mal en deviennent capables.
• Le TGF-β1 et le VEGF, deux marqueurs d'inflammation et de remodelage des petits vaisseaux dans tout le corps.

Ces signaux étaient présents quel que soit le type de céphalée (migraine ou NDPH). Autrement dit, le sang racontait la même histoire chez toutes ces personnes : une inflammation discrète mais persistante, qui se voit dans les analyses.

Quatre mécanismes plausibles à l'étude

Plusieurs mécanismes pourraient contribuer aux céphalées persistantes après Covid. Ils ne sont ni exclusifs ni démontrés chez chaque patient, et leur importance respective reste inconnue^{[1][6] PMID 39326415}.

1. Les cellules immunitaires du cerveau pourraient rester activées. Normalement, elles devraient revenir au calme après l'infection. La fractalkine, une chimiokine associée à leur signalisation, est retrouvée à des concentrations différentes dans le sang selon le profil de céphalée, sans que cela mesure directement une activation microgliale cérébrale.
2. Le système trigémino-vasculaire pourrait être impliqué. C'est le même circuit que dans la migraine classique, où le CGRP est un médiateur central ; son rôle spécifique dans la céphalée post-Covid reste à préciser. Cette hypothèse est d'autant plus plausible que le phénotype de la céphalée est migraineux.
3. Les nerfs de la douleur deviennent plus sensibles. Le facteur β-NGF abaisse leur seuil. Des stimulations habituellement neutres (lumière vive, odeur forte, bruit) deviennent capables de déclencher de la douleur.
4. Les mastocytes pourraient contribuer. Ces cellules immunitaires interagissent avec les voies trigéminales et peuvent libérer histamine, prostaglandines et autres médiateurs. Une activation mastocytaire est proposée dans certains sous-groupes de Covid long, mais son rôle causal dans les céphalées post-Covid n'est pas démontré.

Ces mécanismes peuvent biologiquement interagir, mais leur coexistence chez une même personne n'est pas établie par les études disponibles. C'est ce qui rend les approches en une seule étape souvent insuffisantes.

Ce qui arrive souvent en même temps

Une nouvelle céphalée après un Covid n'arrive presque jamais seule. Elle s'inscrit dans un tableau plus large, où plusieurs autres signes apparaissent en parallèle. Connaître ce tableau est utile pour ne pas isoler la douleur du contexte.

• Tachycardie quand on se met debout (POTS). Le cœur s'accélère, la tête tourne, la fatigue s'installe dès la verticalisation. Le système nerveux qui pilote automatiquement le corps est dérèglé.
• Brouillard mental. Difficulté à se concentrer, oublier ses mots, lenteur de pensée. Même cause de fond : l'inflammation discrète du cerveau.
• Aggravation retardée après l'effort. On se sent à peu près le jour même, puis tout s'effondre 24 à 48 heures après. La céphalée fait partie de ce qui revient. Ce phénomène a un nom : le malaise post-effort.
• Hypersensibilités sensorielles. Lumière, bruit, parfums forts deviennent agressifs. C'est cohérent avec les nerfs sensibilisés par le β-NGF.

Présenter une céphalée seule au médecin n'oriente pas vers les mêmes hypothèses qu'une céphalée + POTS + malaise post-effort. Faire ce tour d'horizon avant la consultation change l'évaluation.

Que faire, par où commencer

Comprendre que cette céphalée est inflammatoire (et pas « dans votre tête ») ouvre des possibilités d'évaluation que la lecture « c'est le stress » fermait. Aucune des pistes ci-dessous n'est une recommandation pour vous personnellement : ce sont des éléments à discuter avec votre professionnel de santé.

L'étape 1 est toujours l'examen précis

Migraine, NDPH, céphalée de tension, céphalée venant du cou : ce ne sont pas les mêmes situations. Les approches diffèrent. Un neurologue spécialiste des céphalées (centres dits « de la migraine ») est le bon premier interlocuteur. Un journal des céphalées sur 4 semaines facilite beaucoup son travail.

Pourquoi parler « anti-inflammatoire » a du sens

Comme l'étude allemande montre clairement un profil inflammatoire, beaucoup d'équipes pensent qu'une approche qui vise à calmer cette inflammation est cohérente. Aucune étude n'a encore validé une stratégie unique pour cette céphalée précise. C'est une discussion à avoir avec votre médecin, qui jugera ce qui s'applique à vous.

Les compléments alimentaires : ce qu'on sait, ce qu'on ne sait pas

Quatre nutriments ont des données solides en migraine classique (mais pas spécifiquement post-Covid) :

• Magnésium, vitamine B2 (riboflavine), coenzyme Q10 : utilisés depuis longtemps en prévention de la migraine, avec un niveau de preuve correct.
• Acide alpha-lipoïque : une méta-analyse publiée en ligne en 2024 puis en volume en 2025, regroupant 22 essais randomisés, montre une réduction de la fréquence et de l'intensité des crises^{[7] PMID 39404918}.

Pour resituer ce lien entre migraine et dysautonomie parmi les autres mécanismes du système nerveux autonome, consultez le hub Dysautonomie et POTS.